Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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