Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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VAMP3Q15836 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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