Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SS18Q15532 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms