Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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