Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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