Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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