Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTTNQ14247 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTTNQ14247 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms