Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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SPIDRQ14159 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SPIDRQ14159 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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SPIDRQ14159 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SPIDRQ14159 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SPIDRQ14159 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SPIDRQ14159 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SPIDRQ14159 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIDRQ14159 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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