Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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KCNC3Q14003 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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KCNC3Q14003 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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KCNC3Q14003 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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KCNC3Q14003 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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KCNC3Q14003 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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KCNC3Q14003 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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KCNC3Q14003 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNC3Q14003 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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