Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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