Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOFQ13790 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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