Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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