Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FHL3Q13643 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms