Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNASE1L3Q13609 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms