Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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