Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLD1Q13393 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLD1Q13393 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms