Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3B2Q13367 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3B2Q13367 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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