Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DUSP4Q13115 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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