Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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