Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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