Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GRIK3Q13003 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK3Q13003 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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