Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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