Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXF1Q12946 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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