Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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