Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC10A2Q12908 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms