Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms