Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSRP1Q08945 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSRP1Q08945 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms