Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms