Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN11Q06124 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms