Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARID5AQ03989 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms