Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB1Q02641 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB1Q02641 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms