Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLCB3Q01970 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLCB3Q01970 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms