Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1DQ01668 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms