Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2BQ00403 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms