Protein–RNA interactions for Protein: P80404

ABAT, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABATP80404 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABATP80404 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABATP80404 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABATP80404 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABATP80404 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms