Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERV-K104P61576 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms