Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms