Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB5BP61020 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RAB5BP61020 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5BP61020 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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