Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP6P59044 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP6P59044 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms