Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF3P57682 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms