Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX9P55771 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX9P55771 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX9P55771 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms