Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52P55327 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TPD52P55327 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPD52P55327 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52P55327 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52P55327 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52P55327 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPD52P55327 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPD52P55327 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms