Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELLP55199 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELLP55199 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ELLP55199 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ELLP55199 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms