Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms