Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms