Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms