Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP98P52948 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP98P52948 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP98P52948 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP98P52948 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP98P52948 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP98P52948 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP98P52948 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP98P52948 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP98P52948 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP98P52948 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms