Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX2P50458 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX2P50458 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX2P50458 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX2P50458 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms