Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP153P49790 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP153P49790 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP153P49790 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms