Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT6CP48668 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms